Тут причины немножко другие: вы не будете восстанавливать эти файлы (по крайней мере, большинство из них); но вы можете сравнить эти файлы с новыми, созданными в процессе установки. Зачем? В новых файлах могут быть данные, отсутствующие в старых; или что-то может быть сделано по-новому. Изменения в протоколах, добавление новых средств, применение новых функций в существующих утилитах могут привести к изменению формата конфигурационных файлов и загрузочных скриптов из дерева каталогов /etc, и, скорее всего, вам придется вносить ваши старые настройки в эти новые форматы, одновременно используя улучшения и дополнения.